Відділення інвазивної та ендокринної хірургії було організовано в 2004 році в зв’язку з впровадженням в практику роботи мініінвазивних технологій. У відділенні проходять лікування хворі з ендокринною патологією, виконуються операції при захворюванні щитоподібної залози, паращитовидної залози а також лікуються хворі з діабетичною стопою. За час роботи відділення підготовлені кадри лікарів – 1 лікар вищої категорії, 1 – 1-ї категорії, 1 – 2-ї категорії, підготовлені операційні, постові медичні сестри, всі освоїли суміжні спеціальності маніпуляційної та перев’язувальної медичної сестри. За час роботи відділення впроваджено більше 30-ти новітніх методик у лікуванні хворих з вказаною патологією. Проводяться оперативні втручання хворим на вторинний гіперпаратирез. 
Це категорія хворих, які потребують гемодіалізу, тому раніше такі хворі оперувалися тільки в клініках міста Києва. Наше відділення єдине в області де оперуються хворі з тиреотоксикозом. Виконуються лапароскопічні втручання на жовчному міхурі та жовчних шляхах, з приводу жовчекам’яної хвороби та її ускладнень. Лапароскопічний вісцероліз, лапароскопічні операції при позаматковій вагітності, лапароскопічне видалення кіст яєчників. Надпіхвова ампутація матки, екстирпація матки. Виконуються діагностичні гістероскопії.
У відділенні виконується до 25% операцій на жовчному міхурі та жовчовивідних шляхах, більше 60% операцій на щитоподібній залозі. За час роботи відділення в зв’язку з концентрацією хворих з важкими гнійними ускладненнями діабетичної стопи по області знизилась кількість ампутацій при цукровому діабеті і цей показник по області нижчий, ніж показник по Україні. Також виконуються оперативні втручання з приводу гінекологічних захворювань.